Kabuto n’est plus sous le contrôle d’Itachi…
Cette version se concentre sur le passage où Kabuto n’est plus sous le contrôle d’Itachi. Kabuto passe d’ailleurs en personnage jouable dans le mode versus. Les cinématiques de Full Burst sont retouchées tandis que 100 nouvelles missions ainsi que les 38 costumes apparus jusque-là en DLC sont directement inclus dans le titre.